禮諸佛已。次復懺悔。弟子眾等。自從無始以來。 至於今日。所有貪瞋嫉妬之病。 憍慢自傲之病不識善惡之病不信罪福之病不孝五逆之病。 破辱三寶之病。不修齋戒之病。破犯尸羅之病。自讚毀他之病。 貪得無厭之病。迷聲逐色之病。貪香愛觸之病。信邪倒見之病。 躭婬嗜酒。放逸無度之病。設復遇醫。授與非藥之病。及無餘量災難陵辱。 悲愁煎逼。身心受苦之病。欲令是等病苦消除。所求願滿。 爾時藥師琉璃光如來入三摩地。 名曰。除滅一切眾生苦惱。既入定已。 於肉髻中。出大光明。光中演說大陀羅尼曰。 南無。薄伽伐帝。鞞殺社。窶嚕薜琉璃。鉢囉婆。喝喇闍也。 怛他揭哆耶。阿囉訶帝。三藐三勃陀野。怛姪他。 唵。鞞殺逝。鞞殺逝。鞞殺社。三沒揭帝莎訶。 爾時光中說此呪已。大地震動。放大光明。 一切眾生。病苦皆除。受安隱樂。是知懺悔之功。 諸病心瘳之靈。劑。了生脫死之奇方有。 大醫王。應病設藥。所謂慈悲喜捨是藥。忍辱柔和是藥。 正信三寶是藥。勤修福慧是藥。六波羅蜜是藥。 飽飡甘露是藥。貪求法味是藥。修真養氣是藥。 返本還元是藥。有過能改是藥。善巧方便是藥。 不動聲色是藥。清心斷慾是藥。常用如是等藥擣篩和合。 時取服之。眾生若病。應同一病。眾生須藥。應同一藥。 若說多法。是名顛倒若據一乘實相而言。則何增何減。何垢何淨。 何善何惡。何罪何福。何病何藥。觀昔方便。 如夢中人。夢身患病。求醫服藥。而得除愈。 及其夢醒。則悟本來無病。無病亦無。而況醫藥。 故眾生之病。同一幻病。如來之藥。同一幻藥。 故知如來說法。一相一味。所謂解脫相。 離相。滅相。究竟涅槃。終歸於空。 如一雲所雨。而藥樹大小。各得滋茂。 我等今者。蒙佛恩力。得聞。世尊藥師琉璃光如來名號。 不復更有病苦之難。乃能究竟無上菩提。 是故今日。我等相率。 皆同一心乃至盡形歸佛法僧。今當歸命一切諸佛。